文献综述查重系统的操作流程包括：1.上传文献：将待查重的文献上传至查重系统；2.系统比对：系统对文献进行比对分析，检测重复内容；3.生成报告：系统生成查重报告，展示查重结果和重复率；4.查看结果：查看具体重复内容并进行修改或引用。

在进行文献综述查重系统的操作流程时，需要注意：1.选择权威系统：选择知名的查重系统，确保结果准确性；2.查重频率：定期进行查重，确保文献原创性；3.合理引用：如有引用他人内容，需合理注明来源；4.修改文献：根据查重结果进行必要的修改，确保文献质量。